基因組所介紹

中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院（深圳）農(nóng)業(yè)基因組研究所（簡(jiǎn)稱“基因組所”），是中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院和深圳市共同舉辦的新型國(guó)家級(jí)研究所。成立四年來，踐行“躍居世界農(nóng)業(yè)科技高端，服務(wù)產(chǎn)業(yè)重大科技需求”國(guó)家使命，服務(wù)于粵港澳大灣區(qū)戰(zhàn)略部署和深圳市國(guó)際科技產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新中心建設(shè)，打造了國(guó)際領(lǐng)先的“種質(zhì)資源收集—基因組測(cè)序和分析—功能基因挖掘—分子設(shè)計(jì)育種”的全鏈條創(chuàng)新平臺(tái)；引進(jìn)了40余位具有國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)力的PI，累計(jì)招收博士后130多名；在農(nóng)業(yè)生物組學(xué)基礎(chǔ)、基因組學(xué)與動(dòng)植物分子育種、基因組學(xué)與動(dòng)植物健康等方向取得了突出成果，在Science、Nature、Cell、NatureGenetics等知名期刊上發(fā)表SCI論文300余篇，奠定了我國(guó)農(nóng)業(yè)基因組學(xué)的國(guó)際地位。

程時(shí)鋒課題組簡(jiǎn)介

中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院（深圳）農(nóng)業(yè)基因組研究所（簡(jiǎn)稱“基因組所”）合成生物學(xué)研究中心程時(shí)鋒團(tuán)隊(duì)致力于植物比較進(jìn)化基因組學(xué)、作物群體遺傳學(xué)、和關(guān)鍵性狀起源和演化機(jī)制的多組學(xué)ENCODE研究。

近年來重點(diǎn)關(guān)注trait-based的Phylo-GWAS研究方法、大規(guī)模比較進(jìn)化基因組學(xué)、作物群體大數(shù)據(jù)gene-trait關(guān)聯(lián)和連鎖研究方法，如開發(fā)多倍體作物（小麥、燕麥等）群體多樣性繪制(包括Pan-genome、Pan-SV和Pan-NLRome)和及高效的GWAS關(guān)聯(lián)分析基因發(fā)現(xiàn)工具和算法，包括開發(fā)kmer-basedGWAS,PAV/SV-GWAS,eGWAS,mGWAS等。

主要項(xiàng)目包括：（1）“谷-豆”國(guó)際基因組聯(lián)盟計(jì)劃（http://www.g3rp.com/）下的禾本科作物和豆科豆類比較基因組和群體基因組；（2）結(jié)瘤生物固氮分支N-fixingRootNoduleSymbiosis祖先新性狀起源與多樣性演化的基因表達(dá)表觀調(diào)控機(jī)制；（3）C4高光合大規(guī)模比較進(jìn)化基因組學(xué)，及其起源和平行演化的基因表達(dá)表觀調(diào)控機(jī)制。團(tuán)隊(duì)先后參與完成了多個(gè)重大項(xiàng)目，相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在Cell、Science、NatureGenetics、NatureBiotechnology、Gigascience、PlantCell、PlantJournal等知名國(guó)際期刊上。目前擁有團(tuán)隊(duì)成員15名，主要來自計(jì)算機(jī)科學(xué)、基因組學(xué)、生物信息學(xué)、植物分子生物學(xué)、進(jìn)化與群體遺傳學(xué)等多個(gè)學(xué)科。

01招聘需求

1.生物信息學(xué)算法開發(fā)博士后1名。

2.生物信息學(xué)算法開發(fā)工程師1名。

3.植物進(jìn)化基因組、多組學(xué)和群體遺傳信息大數(shù)據(jù)分析博士后1名。

4.田間育種專員1名。

02崗位職責(zé)

生信及算法/工具開發(fā)：

1.基因組功能元件、序列模型預(yù)測(cè)深度學(xué)習(xí)算法、流程開發(fā)。

2.植物大規(guī)模系統(tǒng)比較進(jìn)化基因組學(xué)方法構(gòu)建。

3.開發(fā)群體遺傳學(xué)單倍型多樣性挖掘及基因發(fā)現(xiàn)新方法。

4.利用深度學(xué)習(xí)等算法整合基因大數(shù)據(jù)，開發(fā)表征量化可視化方法，開發(fā)數(shù)據(jù)庫，建設(shè)網(wǎng)站在線分析工具。

田間育種專員：

1.作物田間實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、規(guī)劃和管理。

2.作物表型鑒定、組織/核酸/材料提取等樣本文庫制備。

03應(yīng)聘條件

博士后：

1.博士學(xué)位，數(shù)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)理統(tǒng)計(jì)、生物信息學(xué)、物理學(xué)、基因組學(xué)等相關(guān)專業(yè)；熟練使用Linux系統(tǒng)，至少熟練掌握Perl、Python、R、C/C++、JAVA等語言中的兩種。

2.勤于思考，能獨(dú)立開展課題研究，學(xué)術(shù)態(tài)度嚴(yán)謹(jǐn)，善于團(tuán)隊(duì)合作。

3.良好的溝通能力和中英文科技寫作能力。

4.不超過35周歲，近3年在國(guó)際學(xué)術(shù)刊物以第一作者發(fā)表過或即將發(fā)表SCI論文。

生信算法開發(fā)工程師：

1.985/211本科畢業(yè)，生物信息學(xué)或計(jì)算機(jī)專業(yè)。

2.熟練使用Linux系統(tǒng)，至少熟練掌握Perl、Python、R、C/C++、JAVA等語言中的兩種。

3.有相關(guān)工作經(jīng)驗(yàn)者優(yōu)先。

田間育種專員：

1.碩士及以上學(xué)歷，育種相關(guān)專業(yè)，具有作物（小麥優(yōu)先）育種相關(guān)的理論知識(shí)。

2.1年以上從事作物育種的工作經(jīng)驗(yàn)，如作物品種的選育。

3.具有一定的計(jì)算機(jī)運(yùn)用能力，能獨(dú)立完成數(shù)據(jù)收集、錄入和分析。

4.工作認(rèn)真，有責(zé)任感，執(zhí)行力強(qiáng)，工作效率高；良好的溝通能力和團(tuán)隊(duì)協(xié)作能力。

5.英語寫作和口語優(yōu)秀者，優(yōu)先考慮。

04崗位待遇

博士后：

1.在站期間享受深圳市和大鵬新區(qū)的在站博士后生活補(bǔ)貼，共計(jì)稅后60萬元。

2.按照研究所的相關(guān)規(guī)定提供博士后的工資、五險(xiǎn)一金和績(jī)效待遇。

3.博士后人員進(jìn)站后，可選擇落戶深圳市，其配偶及未成年子女可辦理隨遷入戶，并且享受深圳市和大鵬新區(qū)的新引進(jìn)人才生活補(bǔ)貼，共計(jì)稅后6萬元。

4.博士后在站期間鼓勵(lì)申報(bào)中國(guó)博士后基金、國(guó)家自然科學(xué)青年基金，項(xiàng)目結(jié)題且出站后留深工作的可認(rèn)定為深圳市后備級(jí)高層次人才，獎(jiǎng)勵(lì)160萬，若在大鵬新區(qū)工作，另有1:1配套補(bǔ)貼。

生信算法開發(fā)工程師、田間育種專員：

1.薪資待遇面議，相關(guān)社會(huì)保險(xiǎn)及公積金按照深圳市有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。

05申請(qǐng)方式

申請(qǐng)者請(qǐng)將個(gè)人簡(jiǎn)歷（包含教育經(jīng)歷、研究經(jīng)歷、論文發(fā)表）、代表作和研究意向以電子郵件形式發(fā)送至：chengshifeng@caas.cn，郵件主題和材料壓縮文件請(qǐng)注明“姓名+申請(qǐng)職位名稱 ”。

研究所會(huì)仔細(xì)分析并保密所有申請(qǐng)資料，并在收到申請(qǐng)的一個(gè)月內(nèi)與初審合格者電話或E-mail聯(lián)系，安排面試；資格審查未通過者，不再另行告知。

程時(shí)鋒代表論文

　　1. Cheng S*, Xian W, Fu Y, et al. Genomes of SubaerialZygnematophyceae Provide Insights into Land Plant Evolution. Cell, 2019,179(5): 1057-1067. e14.

　　2. Griesmann M, Chang Y, Liu X, et al. Cheng S†. Phylogenomicsreveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis[J]. Science,2018, 361(6398): eaat1743.

　　3. Cheng S*, Melkonian M, Smith SA, et al. 10KP: Aphylodiverse genome sequencing plan. Gigascience. 2018;7(3):1–9.

　　4. Cheng S*, Gutmann B, Zhong X, et al. Redefining thestructural motifs that determine RNA binding and RNA editing bypentatricopeptide repeat proteins in land plants. Plant J.2016;85(4):532–547.

　　5. Lin S, Cheng S*, Song B, et al. The Symbiodiniumkawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science.2015;350(6261):691–694.　

　　6.Cheng S*, van den Bergh E, Zeng P, et al. TheTarenaya hassleriana genome provides insight into reproductive trait and genomeevolution of crucifers. Plant Cell. 2013;25(8):2813–2830.　

　　7. Zhang, G., Liu, X., Quan, Z. Cheng S*. et al. Genomesequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grassevolution and biofuel potential. Nat Biotechnol 30, 549–554 (2012).

來源：

http://www.agis.org.cn/xwzx/tzgg/273999.htm

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