課題組簡介
阮玨課題組，主要研究領域為高通量測序技術下的生物信息學算法研發(fā)和應用。團隊研究方向主要包括全基因組組裝算法、極低頻點突變檢測、基因組結構變異檢測、DNA存儲技術、以及基因組分析技術開發(fā)。1）研發(fā)計算效率極高的三代長序列組裝算法，以降低大型復雜基因組組裝對計算資源的巨大需求；2）為提高結構變異的檢測準確性和敏感性，開發(fā)高效算法；3）為針對性提高基因組極低頻突變測序的檢測效率與數(shù)據(jù)利用率，開發(fā)新型高效測序檢測技術；4）實現(xiàn)產(chǎn)學研結合，將基因組學技術應用到科研項目，輔助解決重大科研問題。
課題組長阮玨，研究員，博士生導師，組學技術研究中心主任，國家優(yōu)秀青年基金獲得者，中國農(nóng)業(yè)科學院“農(nóng)科英才”，農(nóng)業(yè)農(nóng)村部“杰出青年農(nóng)業(yè)科學家”；主要研究領域為基因組序列比對與序列組裝,參與開發(fā)MAQ、SAMTools、SOAPdenovo、Pseudo-sanger、Rainbow、Novobreak、SAMRTdenovo、WTDBG等算法軟件，還設計開發(fā)了Droplet-CirSeq、EasyMF、O2N-Seq等測序方法。學術論文發(fā)表在Nature、Nature Methods、Nature Genetics、Genome Research、Nature Communications、Bioinformatics等期刊，累計他引超過14,000次。（http://www.agis.org.cn/rcpy/nkyrc/zgnykxynkyctszcljrcrxzalblcl/230318.htm）
項目簡介
“國家重點研發(fā)計劃--新型生物納米孔測序技術的研發(fā)及測序儀的研制”針對新型納米孔測序電信號的特點，引入序列組成結構對堿基過孔速度影響的先驗模型，泛化“分割+預測”的網(wǎng)絡結構，擴展識別堿基的字符空間，設計出高效準確的解碼算法，將新型納米孔測序儀產(chǎn)出的電信號解碼為終端用戶可用的堿基序列。
深圳市基礎研究機構“多組學算法研發(fā)”任務，以“從基因組學到表型組學”為核心設計思路，在強化基因組學算法的基礎上，突破組學核心算法技術。創(chuàng)新復雜基因組分析技術，突破超大基因組和多倍體基因組的拼接算法，開發(fā)基于圖論的結構變異檢測算法、多組學數(shù)據(jù)基因注釋整合算法，輕設施表型組圖像識別算法等一系列組學算法技術，初步建成國際農(nóng)業(yè)組學算法研發(fā)中心。
一、招聘需求
現(xiàn)針對以上兩項任務，面向社會公開招聘1.序列分析算法研發(fā)、2.深度學習算法開發(fā)、3.測序實驗方法研發(fā)，等方向的研究人員3~5名，共同參與項目開發(fā)，具體招聘條件如下：
二、崗位要求
1.本科（含）以上學歷；
2.身體健康，年齡在35周歲以下；
3.熟悉掌握分析算法研發(fā)，深度學習編程，測序實驗研發(fā)等技術之一；
4.滿足以下條件的研究人員優(yōu)先：
1）知名算法軟件或實驗技術主要開發(fā)者；
2）有基因組學/生物信息學背景（或經(jīng)驗）者；
3）有深度學習背景（或經(jīng)驗）者；
4）程序設計大賽獲獎者；
5）獨立開發(fā)較大規(guī)模程序代碼者。
1.稅前月薪8000~25000元，根據(jù)能力和經(jīng)驗面議；
2.相關社會保險公積金及其他符合人才政策的待遇按照深圳市有關規(guī)定執(zhí)行；
3.其他：
1）鼓勵以一作或通訊作者發(fā)表學術論文；
2）提供科研晉升通道；
四、應聘方式
請將個人簡歷以電子郵件形式發(fā)送到：ruanjue@caas.cn，郵件主題為“應聘+姓名 ”，個人簡歷應包含教育背景、工作經(jīng)歷、研究成果等。應聘材料請壓縮成一個zip文件以附件發(fā)送。所有應聘材料我們會仔細分析并保密，一旦候選人確定后，將邀請您進行面試。
五、聯(lián)系方式
阮玨：ruanjue@caas.cn、謝欣：xiexin01@caas.cn
為防止簡歷投遞丟失請抄送一份至：boshijob@126.com（郵件標題格式：應聘職位名稱+姓名+學歷+專業(yè)+中國博士人才網(wǎng)）
中國-博士人才網(wǎng)發(fā)布
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