基因組所介紹

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所成立于2014年，由農(nóng)業(yè)農(nóng)村部、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院和深圳市政府共同支持建設(shè)�；�因組所通過整合生物學(xué)和大數(shù)據(jù)科學(xué)，來認(rèn)識與利用農(nóng)業(yè)生物基因組，服務(wù)全球農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。為此，基因組所成立了組學(xué)技術(shù)、合成生物學(xué)、植物基因組、動物基因組、生態(tài)基因組、食品科學(xué)等研究中心和相關(guān)技術(shù)平臺�；�因組所的長期愿景是致力于通過顛覆性創(chuàng)新來促進全球農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展，服務(wù)于個性化食品供給體系，并提升人類健康水平和農(nóng)民社會地位！

成立以來，基因組所深入貫徹落實習(xí)近平總書記“四個面向、兩個一流”指示精神，開展科研自主權(quán)改革試點工作，被列為中國農(nóng)科院現(xiàn)代院所改革的“試驗田”，建立了由中國農(nóng)科院與深圳市主管領(lǐng)導(dǎo)任共同理事長的理事會；組建了1000多人的研究隊伍；形成了以組學(xué)技術(shù)為核心、輻射農(nóng)業(yè)、食品和生態(tài)方向的學(xué)科體系，獲批“嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實驗室深圳分中心”“農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)業(yè)基因數(shù)據(jù)分析重點實驗室”等創(chuàng)新載體；在包括Science、Nature、Cell等頂級期刊在內(nèi)的雜志上發(fā)表SCI論文400多篇，以基因組設(shè)計育種育成國審、省審新品種30余個，農(nóng)業(yè)基因組學(xué)等研究領(lǐng)域占據(jù)世界前沿。2019年以來連續(xù)三年自然指數(shù)排名全國農(nóng)業(yè)類科研院所第一名，多項成果入選“‘十三五’農(nóng)業(yè)科技十大標(biāo)志性成果”“中國生命科學(xué)十大進展”“中國農(nóng)業(yè)科學(xué)十大進展”。先后獲得“何梁何利基金”獎、“周光召基礎(chǔ)科學(xué)獎”“深圳經(jīng)濟特區(qū)建立40周年創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)和先進模范人物”“深圳市市長獎”等獎勵。

程時鋒課題組介紹

程時鋒課題組目前以Trait-based phylogenomics (“C4光合”和“結(jié)瘤固氮”)為框架研究植物獲得適應(yīng)性新性狀的分子機制、以Genomics-design Breeding（“小麥”和“豌豆”群本）為目標(biāo)研究作物群體馴化和設(shè)計育種技術(shù)路線。代表性成果以第一或通訊作者（含共同）發(fā)表在Science（2篇）、CELL、Nature Biotechnology、Plant Cell等雜志，多篇文章被F1000重點推薦；主持國家重點研發(fā)計劃1項，省部級項目2項。

課題組負(fù)責(zé)人程時鋒老師代表性論文

 *第一作者 †通訊作者

 1. Cheng S*, Wong G, Melkonian M. Giant DNA viruses make big strides in eukaryote evolution. Cell Host & Microbe (2021). https://doi.org/10.1016/j.chom.2021.01.008

 2. Cheng S*, Xian W, Fu Y, et al. Genomes of Subaerial Zygnematophyceae Provide Insights into Land Plant Evolution. Cell, 2019, 179(5): 1057-1067. e14.

 3. Griesmann M, Chang Y, Liu X, et al. Cheng S†. Phylogenomics reveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis. Science, 2018, 361(6398): eaat1743.

 4. Cheng S*, Melkonian M, Smith SA, et al. 10KP: A phylodiverse genome sequencing plan. Gigascience. 2018;7(3):1–9.

 5. Cheng S*, Gutmann B, Zhong X, et al. Redefining the structural motifs that determine RNA binding and RNA editing by pentatricopeptide repeat proteins in land plants. Plant J. 2016;85(4):532–547.

 6. Lin S, Cheng S*, Song B, et al. The Symbiodinium kawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science. 2015;350(6261):691–694.

 7. Cheng S*, van den Bergh E, Zeng P, et al. The Tarenaya hassleriana genome provides insight into reproductive trait and genome evolution of crucifers. Plant Cell. 2013;25(8):2813–2830.

 8. Zhang, G., Liu, X., Quan, Z. Cheng S*. et al. Genome sequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grass evolution and biofuel potential. Nat Biotechnol 30, 549–554 (2012).

 6. Lin S, Cheng S*, Song B, et al. The Symbiodinium kawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science. 2015;350(6261):691–694.

 7. Cheng S*, van den Bergh E, Zeng P, et al. The Tarenaya hassleriana genome provides insight into reproductive trait and genome evolution of crucifers. Plant Cell. 2013;25(8):2813–2830.

 8. Zhang, G., Liu, X., Quan, Z. Cheng S*. et al. Genome sequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grass evolution and biofuel potential. Nat Biotechnol 30, 549–554 (2012).

一、招聘崗位

根據(jù)課題組工作需要，擬招聘：

1. 博士后3名。

2. 助理研究員4名。

3. 科研助理1名。

二、崗位職責(zé)

（一）博士后/助理研究員

具體職位可面談

基因組深度學(xué)習(xí)方向（1人）

1. 基因組功能元件、序列模型預(yù)測深度學(xué)習(xí)算法、流程開發(fā)。

2. 植物大規(guī)模系統(tǒng)比較進化基因組學(xué)大數(shù)據(jù)分析和方法構(gòu)建。

3. 作物群體基因組學(xué)與數(shù)量遺傳學(xué)基因發(fā)現(xiàn)，開發(fā)基因與基因、基因與環(huán)境互作研究方法（QTN，QEI，QQI）

4. 開發(fā)群體基因組大的結(jié)構(gòu)性變異(pan-sv)、泛基因(pan-genome)，以及基于大的結(jié)構(gòu)變異與表型關(guān)聯(lián)分析方法（meta-QTL/GWAS）。

5. 負(fù)責(zé)具體麥類與豆類群體項目。

高通量表型與AI算法開發(fā)方向（1人）

1. 開發(fā)高通量表征與量化麥類與豆類表型數(shù)據(jù)技術(shù)方法（分子表型、生理表型及農(nóng)藝表型等）。

2. 開發(fā)作物地下表型表征與量化方法。

3. 利用AI等算法整合基因大數(shù)據(jù)，表型大數(shù)據(jù)，開發(fā)從Genetic variation到Phenotypic changes到Breeding Value表征量化預(yù)測方法。

4. 負(fù)責(zé)具體麥類與豆類群體項目。

比較基因組學(xué)及系統(tǒng)發(fā)育分子進化方向（2人）

1. C4/CAM光合作用方法（1人）

2. 結(jié)瘤共生固氮（1人）

作物遺傳育種方向（1-2人）

1. 作物田間實驗設(shè)計、規(guī)劃和管理。

2. 負(fù)責(zé)育種基地管理和育種項目實施，包括作物的田間雜交、材料管護、品種選育等育種相關(guān)工作。

3. 構(gòu)建小麥或豌豆作圖群體，并開展群體鑒定、多點多年農(nóng)藝性狀表型系統(tǒng)采集與分析。

4. 開展目標(biāo)性狀設(shè)計育種。

（二）科研助理

1. 協(xié)助課題組科研方向調(diào)研、協(xié)助基金與經(jīng)費申請。

2. 協(xié)助課題組項目管理與發(fā)展。

3. 開展國際合作，從全球引進種質(zhì)資源。

4. 協(xié)助團隊綜合行政工作、跨部門協(xié)調(diào)溝通等。

5. 課題組長安排的其他工作。

三、應(yīng)聘條件

（一）博士后

1. 獲得博士學(xué)位，數(shù)學(xué)、計算機科學(xué)、數(shù)理統(tǒng)計、生物信息學(xué)、物理學(xué)、基因組學(xué)、遺傳學(xué)、農(nóng)學(xué)、植物學(xué)等相關(guān)專業(yè)。

2. 原則上近三年以第一作者發(fā)表1篇中國科學(xué)院JCR二區(qū)（含共同第一作者，排名第一位），或影響因子20.0以上的SCI收錄學(xué)術(shù)研究論文（含共同第一作者，排名前兩位）。

3. 基因組深度學(xué)習(xí)、基因編輯、高通量表型與AI算法開發(fā)方向要求熟練使用Linux系統(tǒng)，至少熟練掌握Perl、Python、R、C/C++、JAVA等語言中的兩種，或接受過系統(tǒng)分析生物學(xué)、生物化學(xué)、遺傳學(xué)訓(xùn)練有豐富的分子和細(xì)胞生物學(xué)實驗基礎(chǔ)，能獨立開展植物基因編輯體系構(gòu)建和相關(guān)研究工作。

4. 作物表型和遺傳育種方向要求接受過系統(tǒng)的分子生物學(xué)、種質(zhì)資源學(xué)、遺傳學(xué)培訓(xùn)，具有海外學(xué)習(xí)研究經(jīng)歷和遺傳育種研究背景者優(yōu)先考慮。

5. 熱愛科研，勤于思考，能獨立開展課題研究，學(xué)術(shù)態(tài)度嚴(yán)謹(jǐn)，善于團隊合作。

6. 良好的溝通能力和中英文科研寫作能力。

（二）助理研究員

1. 具有碩士研究生及以上學(xué)歷，數(shù)學(xué)、計算機科學(xué)、數(shù)理統(tǒng)計、生物信息學(xué)、物理學(xué)、基因組學(xué)、遺傳學(xué)、農(nóng)學(xué)、植物學(xué)等相關(guān)專業(yè)。

2. 基因組深度學(xué)習(xí)、基因編輯、高通量表型與AI算法開發(fā)要求熟練使用Linux系統(tǒng)，至少熟練掌握Perl、Python、R、C/C++、JAVA等語言中的兩種，或接受過系統(tǒng)分析生物學(xué)、生物化學(xué)、遺傳學(xué)訓(xùn)練有豐富的分子和細(xì)胞生物學(xué)實驗基礎(chǔ)，能獨立開展植物基因編輯體系構(gòu)建和相關(guān)研究工作。

3. 作物表型和遺傳育種方向要求接受過系統(tǒng)的分子生物學(xué)、種質(zhì)資源學(xué)、遺傳學(xué)培訓(xùn)，具有海外學(xué)習(xí)研究經(jīng)歷和遺傳育種研究背景者優(yōu)先考慮。

4. 熱愛科研，勤于思考，能獨立開展課題研究，學(xué)術(shù)態(tài)度嚴(yán)謹(jǐn)，善于團隊合作。

5. 良好的溝通能力和中英文科研寫作能力。

（三）科研助理

1. 具有本科及以上學(xué)歷，有生命科學(xué)類專業(yè)、英語能力較強者優(yōu)先考慮。

2. 工作認(rèn)真，責(zé)任心強，時間觀念強，有良好的溝通能力、團隊協(xié)作精神。

四、薪資待遇

（一）博士后

1. 按照深圳市、大鵬新區(qū)相關(guān)規(guī)定，博士后在站期間享受在站博士后生活補貼，具體金額以政府最新規(guī)定為準(zhǔn)。

2. 按照研究所的相關(guān)規(guī)定提供博士后的工資、五險一金和績效待遇。

3. 符合條件的，可申請"博士后創(chuàng)新人才支持計劃"、"博士后國際交流計劃派出項目、引進項目"、廣東省海外博士后人才支持項目、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士后"優(yōu)農(nóng)計劃"，在站期間可申報"中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院優(yōu)秀博士后"評審，入選者給予獎金獎勵。

4. 博士后人員進站后，可選擇落戶深圳市，其配偶及未成年子女可辦理隨遷入戶。

5. 符合條件的博士后可申請評定專業(yè)技術(shù)資格。

6. 深圳市對出站博士后留深工作、簽訂3年勞動合同的，給予30萬元資助，用于科研投入或創(chuàng)業(yè)前期費用。

7. 提供良好的工作環(huán)境和充足的研究經(jīng)費，配備研究需要的設(shè)備和儀器，科研方向給予較高自由度。

（二）助理研究員

1. 提供具有市場競爭力的薪資待遇，相關(guān)社會保險及公積金按照深圳市有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。

2.      符合條件的可選擇落戶深圳市，并且享受深圳市人才生活和租房補貼，具體金額以政府最新規(guī)定為準(zhǔn)。

3.      提供良好的工作環(huán)境和充足的研究經(jīng)費，配備精良的實驗儀器，科研方向給予較高自由度。

4.      提供良好的科研環(huán)境和深造學(xué)習(xí)培訓(xùn)的機會，表現(xiàn)優(yōu)異可協(xié)助推薦到國內(nèi)外知名科研單位深造學(xué)習(xí)或開展科研合作。

（三） 科研助理

1. 提供具有市場競爭力的薪資待遇，相關(guān)社會保險及公積金按照深圳市有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。

2.      符合條件的可選擇落戶深圳市，并且享受深圳市人才生活和租房補貼，具體金額以政府最新規(guī)定為準(zhǔn)。

3.      提供良好的科研環(huán)境和深造學(xué)習(xí)培訓(xùn)的機會，表現(xiàn)優(yōu)異可協(xié)助推薦到國內(nèi)外知名科研單位深造學(xué)習(xí)或開展科研合作。

五、申請方式

申請者請將個人簡歷（包含教育經(jīng)歷、研究經(jīng)歷、論文發(fā)表）、代表作和工作規(guī)劃以電子郵件形式發(fā)送至：chengshifeng@caas.cn，抄送郵箱至znkyjyz@163.com。郵件主題和材料壓縮文件請注明"姓名+申請職位名稱 "。

所有應(yīng)聘材料我們將會嚴(yán)格保密，課題組會在收到申請的一個月內(nèi)與初審合格者電話或E-mail聯(lián)系，安排面試。資格審查未通過者，不再另行告知。

為防止簡歷投遞丟失請抄送一份至：boshijob@126.com（郵件標(biāo)題格式：應(yīng)聘職位名稱+姓名+學(xué)歷+專業(yè)+中國博士人才網(wǎng)）